옛날에는 폐기물 관리법에 따라 배지 원료인 중국산 콘코브, 미강 등 부터 폐배지까지 폐기물 처리에 대해 문제가 많았으나 현재는 생물학적 재활용시설에 의한 분류로 되어 일부 버섯을 제외하고 건조하여 사료화나 퇴비화 처리업체를 통해 가공됩니다. 또는 마을 이웃 농가가 있으면 퇴비용으로 줍니다. 보통 세로 4등분하여 고르게 분쇄하여 다른 퇴비물과 함께 적절하게 섞어서 사용합니다. 요즘은 영농활용기술 사례로 미생물 퇴비 제조나 새 배지의 원료로 재활용 적정 첨가, 축유용 배합사료, 굼뱅이 먹이 등 다양하게 활용되고 있습니다.